في 30 حزيران/يونيو 2011، ألقي القبض على السيد السيد في منزله من قبل عناصر من فرع المباحث الجنائية التابعيين لجهاز الشرطة، كانوا يرتدون ملابس مدنية، دون أن يقدموا له حينذاك مذكرة توقيف ودون إبلاغه بسبب القبض عليه.
وعلى إثر ذلك تم اقتياد السيد أبو المعاطى السيد مباشرة إلى مركز فرج للشرطة، حيث تعرض لشتى أصناف التعذيب على أيدي عنصرين من فرع المباحث الجنائية، وهما علي ماهر وسعيد الشعروي اللذان أجبراه على خلع ملابسه وحلق شعر رأسه وحواجبه وشاربة، ثم انهالوا عليه بالضرب على ظهره، وأحرقوه بالسجائر قبل أن يستجوبوه بشأن المكان الذي قد يكون فيه ابن عمه طاهر.
